Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF38BQ5VTL8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms