Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC181Q5TID7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC181Q5TID7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC181Q5TID7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC181Q5TID7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC181Q5TID7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC181Q5TID7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC181Q5TID7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC181Q5TID7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC181Q5TID7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC181Q5TID7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC181Q5TID7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC181Q5TID7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC181Q5TID7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC181Q5TID7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC181Q5TID7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC181Q5TID7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC181Q5TID7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC181Q5TID7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC181Q5TID7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC181Q5TID7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC181Q5TID7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC181Q5TID7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms