Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
KRTAP25-1Q3LHN0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms