Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms