Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms