Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IGSF3O75054 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms