Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms