Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHA12Q9UN75 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms