Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX79

STRA6, Stimulated by retinoic acid gene 6 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRA6Q9BX79 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRA6Q9BX79 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRA6Q9BX79 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRA6Q9BX79 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRA6Q9BX79 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRA6Q9BX79 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRA6Q9BX79 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
STRA6Q9BX79 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
STRA6Q9BX79 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STRA6Q9BX79 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRA6Q9BX79 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms