Protein–RNA interactions for Protein: Q96LP6

C12orf42, Uncharacterized protein C12orf42, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf42Q96LP6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C12orf42Q96LP6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C12orf42Q96LP6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C12orf42Q96LP6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C12orf42Q96LP6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C12orf42Q96LP6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
C12orf42Q96LP6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C12orf42Q96LP6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C12orf42Q96LP6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
C12orf42Q96LP6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C12orf42Q96LP6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C12orf42Q96LP6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C12orf42Q96LP6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C12orf42Q96LP6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C12orf42Q96LP6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C12orf42Q96LP6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C12orf42Q96LP6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C12orf42Q96LP6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C12orf42Q96LP6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C12orf42Q96LP6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C12orf42Q96LP6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C12orf42Q96LP6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C12orf42Q96LP6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C12orf42Q96LP6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C12orf42Q96LP6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C12orf42Q96LP6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C12orf42Q96LP6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C12orf42Q96LP6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C12orf42Q96LP6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C12orf42Q96LP6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C12orf42Q96LP6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C12orf42Q96LP6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C12orf42Q96LP6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C12orf42Q96LP6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
C12orf42Q96LP6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C12orf42Q96LP6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C12orf42Q96LP6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
C12orf42Q96LP6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C12orf42Q96LP6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C12orf42Q96LP6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms