Protein–RNA interactions for Protein: Q92622

RUBCN, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNQ92622 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUBCNQ92622 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms