Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms