Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC93Q567U6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms