Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms