Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RXRAP19793 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RXRAP19793 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RXRAP19793 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RXRAP19793 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RXRAP19793 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RXRAP19793 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RXRAP19793 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RXRAP19793 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RXRAP19793 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RXRAP19793 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RXRAP19793 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RXRAP19793 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RXRAP19793 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RXRAP19793 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RXRAP19793 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RXRAP19793 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RXRAP19793 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RXRAP19793 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RXRAP19793 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RXRAP19793 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RXRAP19793 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RXRAP19793 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RXRAP19793 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RXRAP19793 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RXRAP19793 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RXRAP19793 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RXRAP19793 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RXRAP19793 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RXRAP19793 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RXRAP19793 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RXRAP19793 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RXRAP19793 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RXRAP19793 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RXRAP19793 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RXRAP19793 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RXRAP19793 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RXRAP19793 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RXRAP19793 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RXRAP19793 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RXRAP19793 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RXRAP19793 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RXRAP19793 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RXRAP19793 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RXRAP19793 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RXRAP19793 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RXRAP19793 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RXRAP19793 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RXRAP19793 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RXRAP19793 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RXRAP19793 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RXRAP19793 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RXRAP19793 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RXRAP19793 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RXRAP19793 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RXRAP19793 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RXRAP19793 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RXRAP19793 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RXRAP19793 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RXRAP19793 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RXRAP19793 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RXRAP19793 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RXRAP19793 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RXRAP19793 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RXRAP19793 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RXRAP19793 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RXRAP19793 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RXRAP19793 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RXRAP19793 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RXRAP19793 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RXRAP19793 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RXRAP19793 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RXRAP19793 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RXRAP19793 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RXRAP19793 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RXRAP19793 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RXRAP19793 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RXRAP19793 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RXRAP19793 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RXRAP19793 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RXRAP19793 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RXRAP19793 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RXRAP19793 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RXRAP19793 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RXRAP19793 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RXRAP19793 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RXRAP19793 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RXRAP19793 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RXRAP19793 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RXRAP19793 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RXRAP19793 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RXRAP19793 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RXRAP19793 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RXRAP19793 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RXRAP19793 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RXRAP19793 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RXRAP19793 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RXRAP19793 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RXRAP19793 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RXRAP19793 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms