Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEFLP07196 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEFLP07196 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEFLP07196 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEFLP07196 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEFLP07196 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEFLP07196 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEFLP07196 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEFLP07196 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEFLP07196 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEFLP07196 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEFLP07196 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEFLP07196 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEFLP07196 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEFLP07196 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEFLP07196 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEFLP07196 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEFLP07196 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEFLP07196 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEFLP07196 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEFLP07196 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEFLP07196 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEFLP07196 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEFLP07196 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEFLP07196 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEFLP07196 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEFLP07196 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEFLP07196 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEFLP07196 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEFLP07196 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEFLP07196 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEFLP07196 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEFLP07196 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEFLP07196 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEFLP07196 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEFLP07196 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEFLP07196 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEFLP07196 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEFLP07196 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEFLP07196 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
NEFLP07196 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEFLP07196 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEFLP07196 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEFLP07196 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEFLP07196 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEFLP07196 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
NEFLP07196 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NEFLP07196 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NEFLP07196 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NEFLP07196 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NEFLP07196 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NEFLP07196 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEFLP07196 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEFLP07196 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEFLP07196 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEFLP07196 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEFLP07196 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEFLP07196 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEFLP07196 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEFLP07196 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEFLP07196 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEFLP07196 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEFLP07196 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEFLP07196 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEFLP07196 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEFLP07196 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
NEFLP07196 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEFLP07196 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEFLP07196 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEFLP07196 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEFLP07196 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEFLP07196 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEFLP07196 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEFLP07196 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEFLP07196 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEFLP07196 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEFLP07196 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NEFLP07196 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEFLP07196 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NEFLP07196 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEFLP07196 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEFLP07196 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEFLP07196 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEFLP07196 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEFLP07196 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEFLP07196 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEFLP07196 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEFLP07196 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEFLP07196 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEFLP07196 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEFLP07196 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEFLP07196 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NEFLP07196 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NEFLP07196 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEFLP07196 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEFLP07196 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEFLP07196 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEFLP07196 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEFLP07196 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEFLP07196 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms