Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms