Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU0

ACSL6, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL6Q9UKU0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSL6Q9UKU0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.8 ms