Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSV6

TSEN34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN34Q9BSV6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSEN34Q9BSV6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms