Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEY7

USP33, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 33, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP33Q8TEY7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP33Q8TEY7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP33Q8TEY7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms