Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTL3Q8N8U3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms