Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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