Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD1Q15797 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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