Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSHL1Q14406 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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