Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIGQ13278 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIGQ13278 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIGQ13278 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIGQ13278 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIGQ13278 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIGQ13278 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIGQ13278 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIGQ13278 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIGQ13278 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIGQ13278 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIGQ13278 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIGQ13278 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIGQ13278 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIGQ13278 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIGQ13278 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIGQ13278 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIGQ13278 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIGQ13278 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIGQ13278 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIGQ13278 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIGQ13278 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIGQ13278 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIGQ13278 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIGQ13278 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIGQ13278 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIGQ13278 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIGQ13278 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIGQ13278 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIGQ13278 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIGQ13278 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIGQ13278 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIGQ13278 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIGQ13278 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIGQ13278 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIGQ13278 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIGQ13278 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIGQ13278 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIGQ13278 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIGQ13278 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIGQ13278 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIGQ13278 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIGQ13278 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIGQ13278 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIGQ13278 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIGQ13278 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIGQ13278 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIGQ13278 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIGQ13278 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIGQ13278 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIGQ13278 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIGQ13278 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RIGQ13278 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIGQ13278 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIGQ13278 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIGQ13278 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIGQ13278 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIGQ13278 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIGQ13278 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIGQ13278 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIGQ13278 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RIGQ13278 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RIGQ13278 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIGQ13278 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIGQ13278 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIGQ13278 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIGQ13278 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIGQ13278 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIGQ13278 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIGQ13278 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIGQ13278 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIGQ13278 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIGQ13278 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIGQ13278 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIGQ13278 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIGQ13278 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIGQ13278 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIGQ13278 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIGQ13278 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIGQ13278 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIGQ13278 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIGQ13278 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIGQ13278 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIGQ13278 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIGQ13278 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIGQ13278 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIGQ13278 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIGQ13278 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIGQ13278 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIGQ13278 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIGQ13278 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIGQ13278 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIGQ13278 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIGQ13278 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIGQ13278 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIGQ13278 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIGQ13278 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RIGQ13278 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RIGQ13278 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
RIGQ13278 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
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