Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HSPB3Q12988 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms