Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C6orf47O95873 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C6orf47O95873 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms