Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DFFAO00273 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DFFAO00273 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DFFAO00273 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DFFAO00273 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DFFAO00273 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DFFAO00273 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DFFAO00273 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DFFAO00273 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DFFAO00273 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DFFAO00273 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DFFAO00273 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DFFAO00273 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DFFAO00273 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DFFAO00273 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DFFAO00273 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DFFAO00273 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DFFAO00273 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DFFAO00273 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DFFAO00273 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DFFAO00273 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DFFAO00273 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DFFAO00273 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DFFAO00273 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DFFAO00273 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DFFAO00273 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DFFAO00273 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DFFAO00273 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DFFAO00273 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DFFAO00273 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DFFAO00273 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DFFAO00273 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DFFAO00273 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DFFAO00273 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DFFAO00273 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DFFAO00273 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DFFAO00273 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DFFAO00273 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DFFAO00273 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DFFAO00273 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DFFAO00273 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DFFAO00273 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DFFAO00273 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DFFAO00273 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DFFAO00273 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DFFAO00273 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DFFAO00273 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DFFAO00273 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DFFAO00273 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
DFFAO00273 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DFFAO00273 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DFFAO00273 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DFFAO00273 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DFFAO00273 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DFFAO00273 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DFFAO00273 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DFFAO00273 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DFFAO00273 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DFFAO00273 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DFFAO00273 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DFFAO00273 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DFFAO00273 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DFFAO00273 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DFFAO00273 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DFFAO00273 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DFFAO00273 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DFFAO00273 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DFFAO00273 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DFFAO00273 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DFFAO00273 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DFFAO00273 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DFFAO00273 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DFFAO00273 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DFFAO00273 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DFFAO00273 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DFFAO00273 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DFFAO00273 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DFFAO00273 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DFFAO00273 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DFFAO00273 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DFFAO00273 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DFFAO00273 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DFFAO00273 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DFFAO00273 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DFFAO00273 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DFFAO00273 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DFFAO00273 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DFFAO00273 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DFFAO00273 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DFFAO00273 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DFFAO00273 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DFFAO00273 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DFFAO00273 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DFFAO00273 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DFFAO00273 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DFFAO00273 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DFFAO00273 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DFFAO00273 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DFFAO00273 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DFFAO00273 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms