Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ3A6PVS8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ3A6PVS8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ3A6PVS8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ3A6PVS8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ3A6PVS8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ3A6PVS8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ3A6PVS8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ3A6PVS8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ3A6PVS8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ3A6PVS8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ3A6PVS8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ3A6PVS8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ3A6PVS8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRIQ3A6PVS8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRIQ3A6PVS8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRIQ3A6PVS8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRIQ3A6PVS8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LRRIQ3A6PVS8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LRRIQ3A6PVS8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LRRIQ3A6PVS8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LRRIQ3A6PVS8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms