Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I7

CLDN16, Claudin-16, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16Q9Y5I7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CLDN16Q9Y5I7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms