Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXND1Q9Y4D7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLXND1Q9Y4D7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLXND1Q9Y4D7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLXND1Q9Y4D7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLXND1Q9Y4D7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLXND1Q9Y4D7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLXND1Q9Y4D7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLXND1Q9Y4D7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLXND1Q9Y4D7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLXND1Q9Y4D7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLXND1Q9Y4D7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLXND1Q9Y4D7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PLXND1Q9Y4D7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLXND1Q9Y4D7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLXND1Q9Y4D7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLXND1Q9Y4D7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLXND1Q9Y4D7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLXND1Q9Y4D7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLXND1Q9Y4D7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PLXND1Q9Y4D7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLXND1Q9Y4D7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms