Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFE2L3Q9Y4A8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFE2L3Q9Y4A8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFE2L3Q9Y4A8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFE2L3Q9Y4A8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NFE2L3Q9Y4A8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFE2L3Q9Y4A8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFE2L3Q9Y4A8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NFE2L3Q9Y4A8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFE2L3Q9Y4A8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFE2L3Q9Y4A8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFE2L3Q9Y4A8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFE2L3Q9Y4A8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NFE2L3Q9Y4A8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
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