Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDP1Q9P0J1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms