Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CASS4Q9NQ75 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms