Protein–RNA interactions for Protein: Q96LM1

LINC00615, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00615, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00615Q96LM1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LINC00615Q96LM1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.8 ms