Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK2

SOHLH1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1Q5JUK2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOHLH1Q5JUK2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms