Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIF1AQ16665 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIF1AQ16665 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
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