Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC18A3Q16572 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
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