Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPRKQ15262 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PTPRKQ15262 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PTPRKQ15262 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PTPRKQ15262 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PTPRKQ15262 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PTPRKQ15262 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PTPRKQ15262 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PTPRKQ15262 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PTPRKQ15262 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
PTPRKQ15262 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PTPRKQ15262 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
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