Protein–RNA interactions for Protein: Q13487

SNAPC2, snRNA-activating protein complex subunit 2, humanhuman

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC2Q13487 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNAPC2Q13487 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNAPC2Q13487 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNAPC2Q13487 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNAPC2Q13487 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNAPC2Q13487 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNAPC2Q13487 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNAPC2Q13487 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNAPC2Q13487 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNAPC2Q13487 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNAPC2Q13487 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNAPC2Q13487 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNAPC2Q13487 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNAPC2Q13487 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SNAPC2Q13487 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNAPC2Q13487 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNAPC2Q13487 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNAPC2Q13487 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNAPC2Q13487 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNAPC2Q13487 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNAPC2Q13487 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNAPC2Q13487 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNAPC2Q13487 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNAPC2Q13487 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNAPC2Q13487 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNAPC2Q13487 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNAPC2Q13487 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNAPC2Q13487 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNAPC2Q13487 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SNAPC2Q13487 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNAPC2Q13487 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNAPC2Q13487 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNAPC2Q13487 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNAPC2Q13487 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SNAPC2Q13487 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNAPC2Q13487 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNAPC2Q13487 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNAPC2Q13487 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNAPC2Q13487 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNAPC2Q13487 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNAPC2Q13487 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNAPC2Q13487 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNAPC2Q13487 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNAPC2Q13487 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNAPC2Q13487 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNAPC2Q13487 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNAPC2Q13487 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
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