Protein–RNA interactions for Protein: P52292

KPNA2, Importin subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA2P52292 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KPNA2P52292 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms