Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP5P51878 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP5P51878 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP5P51878 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP5P51878 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP5P51878 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP5P51878 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP5P51878 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP5P51878 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP5P51878 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP5P51878 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP5P51878 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP5P51878 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP5P51878 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP5P51878 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP5P51878 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP5P51878 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP5P51878 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP5P51878 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP5P51878 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP5P51878 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP5P51878 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP5P51878 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP5P51878 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP5P51878 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP5P51878 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP5P51878 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP5P51878 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP5P51878 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP5P51878 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP5P51878 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP5P51878 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP5P51878 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP5P51878 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP5P51878 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP5P51878 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP5P51878 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP5P51878 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP5P51878 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP5P51878 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP5P51878 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP5P51878 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP5P51878 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP5P51878 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP5P51878 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP5P51878 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP5P51878 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP5P51878 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASP5P51878 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASP5P51878 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASP5P51878 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CASP5P51878 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP5P51878 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP5P51878 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP5P51878 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP5P51878 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP5P51878 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP5P51878 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP5P51878 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP5P51878 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP5P51878 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP5P51878 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP5P51878 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP5P51878 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP5P51878 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP5P51878 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP5P51878 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP5P51878 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP5P51878 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP5P51878 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP5P51878 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP5P51878 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP5P51878 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP5P51878 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP5P51878 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP5P51878 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP5P51878 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP5P51878 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP5P51878 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP5P51878 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP5P51878 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP5P51878 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP5P51878 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP5P51878 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP5P51878 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP5P51878 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP5P51878 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP5P51878 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP5P51878 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP5P51878 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP5P51878 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP5P51878 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP5P51878 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP5P51878 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP5P51878 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP5P51878 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP5P51878 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP5P51878 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP5P51878 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP5P51878 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.9 ms