Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 SPT23YKL020C 3249 nt4.14□□□□□ -1.75
SEC28P40509 RAD1YPL022W 3303 nt4.14□□□□□ -1.75
SEC28P40509 VPS73YGL104C 1461 nt4.13□□□□□ -1.75
SEC28P40509 MSS2YDL107W 1056 nt4.13□□□□□ -1.75
SEC28P40509 SCL1YGL011C 759 nt4.13□□□□□ -1.75
SEC28P40509 YGR219WYGR219W 342 nt4.13□□□□□ -1.75
SEC28P40509 BET1YIL004C 429 nt4.13□□□□□ -1.75
SEC28P40509 SRP40YKR092C 1221 nt4.13□□□□□ -1.75
SEC28P40509 ISA1YLL027W 753 nt4.13□□□□□ -1.75
SEC28P40509 IST1YNL265C 897 nt4.13□□□□□ -1.75
SEC28P40509 YNR071CYNR071C 1029 nt4.13□□□□□ -1.75
SEC28P40509 BMT2YBR141C 1014 nt4.13□□□□□ -1.75
SEC28P40509 KIC1YHR102W 3243 nt4.13□□□□□ -1.75
SEC28P40509 TPA1YER049W 1935 nt4.13□□□□□ -1.75
SEC28P40509 TOG1YER184C 2385 nt4.12□□□□□ -1.75
SEC28P40509 ELO2YCR034W 1044 nt4.12□□□□□ -1.75
SEC28P40509 RCR2YDR003W 633 nt4.12□□□□□ -1.75
SEC28P40509 NSE3YDR288W 912 nt4.12□□□□□ -1.75
SEC28P40509 YGL118CYGL118C 438 nt4.12□□□□□ -1.75
SEC28P40509 GTF1YGR102C 552 nt4.12□□□□□ -1.75
SEC28P40509 ADD66YKL206C 804 nt4.12□□□□□ -1.75
SEC28P40509 YLR156WYLR156W 345 nt4.12□□□□□ -1.75
SEC28P40509 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt4.12□□□□□ -1.75
SEC28P40509 YLR159WYLR159W 345 nt4.12□□□□□ -1.75
SEC28P40509 YLR161WYLR161W 345 nt4.12□□□□□ -1.75
SEC28P40509 SEC72YLR292C 582 nt4.12□□□□□ -1.75
SEC28P40509 TMA16YOR252W 537 nt4.12□□□□□ -1.75
SEC28P40509 YBR103C-AYBR103C-A 144 nt4.12□□□□□ -1.75
SEC28P40509 YBR141W-AYBR141W-A 96 nt4.12□□□□□ -1.75
SEC28P40509 snR34snR34 203 nt4.12□□□□□ -1.75
SEC28P40509 PRS5YOL061W 1491 nt4.11□□□□□ -1.75
SEC28P40509 SSH1YBR283C 1473 nt4.11□□□□□ -1.75
SEC28P40509 TRF5YNL299W 1929 nt4.11□□□□□ -1.75
SEC28P40509 PMC1YGL006W 3522 nt4.11□□□□□ -1.75
SEC28P40509 KRE28YDR532C 1158 nt4.11□□□□□ -1.75
SEC28P40509 IRC6YFR043C 714 nt4.11□□□□□ -1.75
SEC28P40509 EDC1YGL222C 528 nt4.11□□□□□ -1.75
SEC28P40509 LSB1YGR136W 726 nt4.11□□□□□ -1.75
SEC28P40509 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt4.11□□□□□ -1.75
SEC28P40509 ERV29YGR284C 933 nt4.11□□□□□ -1.75
SEC28P40509 YUH1YJR099W 711 nt4.11□□□□□ -1.75
SEC28P40509 RPL14AYKL006W 417 nt4.11□□□□□ -1.75
SEC28P40509 RUF21RUF21 707 nt4.11□□□□□ -1.75
SEC28P40509 YPL077CYPL077C 723 nt4.11□□□□□ -1.75
SEC28P40509 PRP3YDR473C 1410 nt4.11□□□□□ -1.75
SEC28P40509 FLC1YPL221W 2382 nt4.11□□□□□ -1.75
SEC28P40509 BRE4YDL231C 3378 nt4.1□□□□□ -1.75
SEC28P40509 RPS13YDR064W 456 nt4.1□□□□□ -1.75
SEC28P40509 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt4.1□□□□□ -1.75
SEC28P40509 RPL18BYNL301C 561 nt4.1□□□□□ -1.75
SEC28P40509 RPL18AYOL120C 561 nt4.1□□□□□ -1.75
SEC28P40509 YOR186WYOR186W 435 nt4.1□□□□□ -1.75
SEC28P40509 DSS4YPR017C 432 nt4.1□□□□□ -1.75
SEC28P40509 MCD4YKL165C 2760 nt4.1□□□□□ -1.75
SEC28P40509 CHL1YPL008W 2586 nt4.09□□□□□ -1.75
SEC28P40509 NHX1YDR456W 1902 nt4.09□□□□□ -1.75
SEC28P40509 MIS1YBR084W 2928 nt4.09□□□□□ -1.75
SEC28P40509 RPC11YDR045C 333 nt4.09□□□□□ -1.75
SEC28P40509 YHR112CYHR112C 1137 nt4.09□□□□□ -1.75
SEC28P40509 REE1YJL217W 597 nt4.09□□□□□ -1.75
SEC28P40509 BAT2YJR148W 1131 nt4.09□□□□□ -1.75
SEC28P40509 HRT1YOL133W 366 nt4.09□□□□□ -1.75
SEC28P40509 LOS1YKL205W 3303 nt4.09□□□□□ -1.76
SEC28P40509 AZR1YGR224W 1842 nt4.09□□□□□ -1.76
SEC28P40509 PMS1YNL082W 2622 nt4.08□□□□□ -1.76
SEC28P40509 UPC2YDR213W 2742 nt4.08□□□□□ -1.76
SEC28P40509 YCR007CYCR007C 720 nt4.08□□□□□ -1.76
SEC28P40509 BUD25YER014C-A 462 nt4.08□□□□□ -1.76
SEC28P40509 KIP3YGL216W 2418 nt4.08□□□□□ -1.76
SEC28P40509 CTK1YKL139W 1587 nt4.08□□□□□ -1.76
SEC28P40509 SEG1YMR086W 2883 nt4.08□□□□□ -1.76
SEC28P40509 YNL144W-AYNL144W-A 84 nt4.08□□□□□ -1.76
SEC28P40509 MET16YPR167C 786 nt4.08□□□□□ -1.76
SEC28P40509 FES1YBR101C 873 nt4.08□□□□□ -1.76
SEC28P40509 EFM2YBR271W 1260 nt4.08□□□□□ -1.76
SEC28P40509 GRS2YPR081C 1857 nt4.07□□□□□ -1.76
SEC28P40509 RSM23YGL129C 1353 nt4.07□□□□□ -1.76
SEC28P40509 RPS11AYDR025W 471 nt4.07□□□□□ -1.76
SEC28P40509 YDR161WYDR161W 1164 nt4.07□□□□□ -1.76
SEC28P40509 SPC19YDR201W 498 nt4.07□□□□□ -1.76
SEC28P40509 RTA1YGR213C 954 nt4.07□□□□□ -1.76
SEC28P40509 PWR1PWR1 941 nt4.07□□□□□ -1.76
SEC28P40509 OPY1YBR129C 987 nt4.07□□□□□ -1.76
SEC28P40509 YPK9YOR291W 4419 nt4.07□□□□□ -1.76
SEC28P40509 APL4YPR029C 2499 nt4.06□□□□□ -1.76
SEC28P40509 PEP7YDR323C 1548 nt4.06□□□□□ -1.76
SEC28P40509 RSC58YLR033W 1509 nt4.06□□□□□ -1.76
SEC28P40509 YGR149WYGR149W 1299 nt4.06□□□□□ -1.76
SEC28P40509 MTR2YKL186C 555 nt4.06□□□□□ -1.76
SEC28P40509 ARG80YMR042W 534 nt4.06□□□□□ -1.76
SEC28P40509 YNL057WYNL057W 333 nt4.06□□□□□ -1.76
SEC28P40509 TMC1YOR052C 453 nt4.06□□□□□ -1.76
SEC28P40509 TAF14YPL129W 735 nt4.06□□□□□ -1.76
SEC28P40509 RTS1YOR014W 2274 nt4.06□□□□□ -1.76
SEC28P40509 FRT2YAL028W 1587 nt4.06□□□□□ -1.76
SEC28P40509 SLM5YCR024C 1479 nt4.05□□□□□ -1.76
SEC28P40509 MSA1YOR066W 1890 nt4.05□□□□□ -1.76
SEC28P40509 KRE29YER038C 1395 nt4.05□□□□□ -1.76
SEC28P40509 VAC7YNL054W 3498 nt4.05□□□□□ -1.76
SEC28P40509 HAT2YEL056W 1206 nt4.05□□□□□ -1.76
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