RNA–Protein interactions for RNA: YHR112C

YHR112C, Transcript of Protein of unknown function, yeastyeast

Gene YHR112C, Length 1,137 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR112CYHR112C MTC1P47018 478 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
YHR112CYHR112C DRS1P32892 752 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
YHR112CYHR112C DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
YHR112CYHR112C FAP1P53971 965 aa13.24□□□□□ -0.29
YHR112CYHR112C BFR2Q06631 534 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
YHR112CYHR112C AVT3P36062 692 aa12.95□□□□□ -0.34
YHR112CYHR112C ISW2Q08773 1120 aa12.89□□□□□ -0.35
YHR112CYHR112C PRI1P10363 409 aa12.76□□□□□ -0.37
YHR112CYHR112C RPG1P38249 964 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
YHR112CYHR112C RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
YHR112CYHR112C AAD16Q02895 342 aa12.61□□□□□ -0.39
YHR112CYHR112C PRY3P47033 881 aa12.36□□□□□ -0.43
YHR112CYHR112C TFA1P36100 482 aa12.23□□□□□ -0.45
YHR112CYHR112C RPL17AP05740 184 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
YHR112CYHR112C RPL17BP46990 184 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
YHR112CYHR112C TSR3Q12094 313 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
YHR112CYHR112C REB1P21538 810 aa12.06□□□□□ -0.48
YHR112CYHR112C HAA1Q12753 694 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
YHR112CYHR112C MRPL32P25348 183 aa11.7□□□□□ -0.54
YHR112CYHR112C SPT21P35209 758 aa11.6□□□□□ -0.55
YHR112CYHR112C YCK3P39962 524 aa11.54□□□□□ -0.56
YHR112CYHR112C RIM101P33400 625 aa11.43□□□□□ -0.58
YHR112CYHR112C YKR023WP36119 530 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
YHR112CYHR112C CDC27P38042 758 aa11.12□□□□□ -0.63
YHR112CYHR112C TFC8Q12308 588 aa11.11□□□□□ -0.63
YHR112CYHR112C HOP09932 586 aa11.07□□□□□ -0.64
YHR112CYHR112C OXP1P28273 1286 aa11.02□□□□□ -0.65
YHR112CYHR112C YGL015CP33199 130 aa11.02□□□□□ -0.65
YHR112CYHR112C YIL055CP40523 627 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
YHR112CYHR112C DCD1P06773 312 aa10.95□□□□□ -0.66
YHR112CYHR112C PTP3P40048 928 aa10.9□□□□□ -0.66
YHR112CYHR112C YAH1Q12184 172 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
YHR112CYHR112C UBP10P53874 792 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
YHR112CYHR112C SSP1P38871 571 aa10.81□□□□□ -0.68
YHR112CYHR112C RSM7P47150 247 aa10.77□□□□□ -0.69
YHR112CYHR112C BCH2P36122 765 aa10.76□□□□□ -0.69
YHR112CYHR112C ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data10.75□□□□□ -0.69not detected
YHR112CYHR112C MAP2P38174 421 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
YHR112CYHR112C YLR271WQ06152 274 aa10.68□□□□□ -0.7
YHR112CYHR112C SCY1P53009 804 aa10.66□□□□□ -0.7
YHR112CYHR112C BBC1P47068 1157 aa10.63□□□□□ -0.71
YHR112CYHR112C AI2P03876 854 aa10.59□□□□□ -0.71
YHR112CYHR112C EPS1P40557 701 aa10.57□□□□□ -0.72
YHR112CYHR112C SLX5P32828 619 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
YHR112CYHR112C BDF1P35817 686 aa10.5□□□□□ -0.73
YHR112CYHR112C MGA2P40578 1113 aa10.49□□□□□ -0.73
YHR112CYHR112C TIF4632P39936 914 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
YHR112CYHR112C PSD2P53037 1138 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
YHR112CYHR112C TGL3P40308 642 aa10.33□□□□□ -0.76
YHR112CYHR112C CST9Q06032 482 aa10.31□□□□□ -0.76
YHR112CYHR112C MRM1P25270 412 aa10.24□□□□□ -0.77
YHR112CYHR112C RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
YHR112CYHR112C RTG3P38165 486 aa10.15□□□□□ -0.78
YHR112CYHR112C NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data10.11□□□□□ -0.79not detected
YHR112CYHR112C YAP5P40574 245 aa10.06□□□□□ -0.8
YHR112CYHR112C YOR238WQ08634 303 aa10.02□□□□□ -0.81
YHR112CYHR112C YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data9.99□□□□□ -0.81not detected
YHR112CYHR112C VPS29P38759 282 aa9.98□□□□□ -0.81
YHR112CYHR112C MST1P07236 462 aa9.96□□□□□ -0.82
YHR112CYHR112C RCR1P38212 213 aa9.96□□□□□ -0.82
YHR112CYHR112C RAM2P29703 316 aa9.92□□□□□ -0.82
YHR112CYHR112C DMA1P38823 416 aa9.92□□□□□ -0.82
YHR112CYHR112C DBP1P24784 617 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
YHR112CYHR112C MAK11P20484 414 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
YHR112CYHR112C UBP9P39967 754 aa9.84□□□□□ -0.83
YHR112CYHR112C STS1P38637 319 aa9.83□□□□□ -0.84
YHR112CYHR112C GTT3P39996 337 aa9.83□□□□□ -0.84
YHR112CYHR112C YFR006WP43590 535 aa9.82□□□□□ -0.84
YHR112CYHR112C PIB1Q06651 286 aa9.81□□□□□ -0.84
YHR112CYHR112C VMA1P17255 1071 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
YHR112CYHR112C NOP53Q12080 455 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
YHR112CYHR112C COQ8P27697 501 aa9.71□□□□□ -0.86
YHR112CYHR112C MIF2P35201 549 aa9.71□□□□□ -0.86
YHR112CYHR112C SET1P38827 1080 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
YHR112CYHR112C BUD31P25337 157 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
YHR112CYHR112C SAM3Q08986 587 aa9.66□□□□□ -0.86
YHR112CYHR112C IFH1P39520 1085 aa9.65□□□□□ -0.86
YHR112CYHR112C WSC3Q12215 556 aa9.63□□□□□ -0.87
YHR112CYHR112C MSB4Q12317 492 aa9.63□□□□□ -0.87
YHR112CYHR112C YBL029C-AQ3E756 94 aa9.62□□□□□ -0.87
YHR112CYHR112C PTC3P34221 468 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
YHR112CYHR112C EDS1P38073 919 aa9.6□□□□□ -0.87
YHR112CYHR112C VNX1P42839 908 aa9.6□□□□□ -0.87
YHR112CYHR112C ABP1P15891 592 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
YHR112CYHR112C GYP5Q12344 894 aa9.59□□□□□ -0.87
YHR112CYHR112C EAP1P36041 632 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
YHR112CYHR112C YOL036WQ08206 761 aa9.58□□□□□ -0.88
YHR112CYHR112C GRE2Q12068 342 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
YHR112CYHR112C SPP1Q03012 353 aa9.56□□□□□ -0.88
YHR112CYHR112C SET4P42948 560 aa9.55□□□□□ -0.88
YHR112CYHR112C ATH1P48016 1211 aa9.55□□□□□ -0.88
YHR112CYHR112C GUT1P32190 709 aa9.53□□□□□ -0.88
YHR112CYHR112C TIF11P38912 153 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
YHR112CYHR112C SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
YHR112CYHR112C YPR148CQ06523 435 aa9.5□□□□□ -0.89
YHR112CYHR112C HTA1P04911 132 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
YHR112CYHR112C HTA2P04912 132 aa9.48□□□□□ -0.89
YHR112CYHR112C ULI1P43604 169 aa9.47□□□□□ -0.89
YHR112CYHR112C DCW1P36091 449 aa9.46□□□□□ -0.9
YHR112CYHR112C CKB1P43639 278 aa9.44□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 57.9 ms