Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJB6O95452 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
GJB6O95452 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJB6O95452 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
GJB6O95452 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
GJB6O95452 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJB6O95452 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJB6O95452 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJB6O95452 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJB6O95452 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJB6O95452 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJB6O95452 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GJB6O95452 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJB6O95452 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB6O95452 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB6O95452 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB6O95452 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB6O95452 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB6O95452 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB6O95452 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB6O95452 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB6O95452 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB6O95452 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB6O95452 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB6O95452 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB6O95452 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB6O95452 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB6O95452 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB6O95452 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB6O95452 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB6O95452 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB6O95452 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB6O95452 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB6O95452 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB6O95452 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB6O95452 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB6O95452 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB6O95452 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB6O95452 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB6O95452 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB6O95452 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB6O95452 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB6O95452 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB6O95452 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB6O95452 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB6O95452 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB6O95452 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB6O95452 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB6O95452 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB6O95452 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB6O95452 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB6O95452 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB6O95452 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB6O95452 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB6O95452 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB6O95452 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB6O95452 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB6O95452 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB6O95452 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB6O95452 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB6O95452 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB6O95452 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB6O95452 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB6O95452 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB6O95452 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB6O95452 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB6O95452 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB6O95452 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB6O95452 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB6O95452 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB6O95452 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB6O95452 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB6O95452 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB6O95452 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB6O95452 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB6O95452 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB6O95452 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB6O95452 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB6O95452 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB6O95452 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB6O95452 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB6O95452 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB6O95452 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB6O95452 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB6O95452 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB6O95452 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GJB6O95452 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GJB6O95452 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GJB6O95452 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GJB6O95452 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GJB6O95452 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GJB6O95452 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GJB6O95452 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB6O95452 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB6O95452 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB6O95452 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB6O95452 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB6O95452 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB6O95452 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB6O95452 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.9 ms