Protein–RNA interactions for Protein: O95395

GCNT3, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT3O95395 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCNT3O95395 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCNT3O95395 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCNT3O95395 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCNT3O95395 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCNT3O95395 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCNT3O95395 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCNT3O95395 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCNT3O95395 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCNT3O95395 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCNT3O95395 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCNT3O95395 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCNT3O95395 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCNT3O95395 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCNT3O95395 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCNT3O95395 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCNT3O95395 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCNT3O95395 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCNT3O95395 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCNT3O95395 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCNT3O95395 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCNT3O95395 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCNT3O95395 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCNT3O95395 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCNT3O95395 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCNT3O95395 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCNT3O95395 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCNT3O95395 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCNT3O95395 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCNT3O95395 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GCNT3O95395 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCNT3O95395 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCNT3O95395 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCNT3O95395 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCNT3O95395 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms