Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCP110O43303 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCP110O43303 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCP110O43303 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCP110O43303 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCP110O43303 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCP110O43303 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCP110O43303 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCP110O43303 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCP110O43303 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCP110O43303 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCP110O43303 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCP110O43303 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCP110O43303 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCP110O43303 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCP110O43303 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCP110O43303 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCP110O43303 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCP110O43303 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCP110O43303 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCP110O43303 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCP110O43303 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCP110O43303 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCP110O43303 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCP110O43303 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCP110O43303 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCP110O43303 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCP110O43303 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCP110O43303 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCP110O43303 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCP110O43303 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCP110O43303 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCP110O43303 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCP110O43303 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCP110O43303 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCP110O43303 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCP110O43303 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCP110O43303 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCP110O43303 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCP110O43303 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCP110O43303 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCP110O43303 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCP110O43303 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCP110O43303 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCP110O43303 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCP110O43303 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCP110O43303 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCP110O43303 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCP110O43303 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCP110O43303 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCP110O43303 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCP110O43303 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCP110O43303 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCP110O43303 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCP110O43303 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCP110O43303 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCP110O43303 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCP110O43303 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCP110O43303 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCP110O43303 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCP110O43303 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCP110O43303 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCP110O43303 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCP110O43303 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCP110O43303 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCP110O43303 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCP110O43303 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCP110O43303 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCP110O43303 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCP110O43303 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCP110O43303 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCP110O43303 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCP110O43303 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCP110O43303 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCP110O43303 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCP110O43303 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCP110O43303 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCP110O43303 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCP110O43303 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCP110O43303 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCP110O43303 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCP110O43303 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCP110O43303 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCP110O43303 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCP110O43303 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCP110O43303 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCP110O43303 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCP110O43303 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCP110O43303 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCP110O43303 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCP110O43303 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCP110O43303 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCP110O43303 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCP110O43303 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCP110O43303 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCP110O43303 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCP110O43303 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCP110O43303 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCP110O43303 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCP110O43303 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms