Protein–RNA interactions for Protein: A6NEV1

PRR23A, Proline-rich protein 23A, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR23AA6NEV1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRR23AA6NEV1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRR23AA6NEV1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRR23AA6NEV1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRR23AA6NEV1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRR23AA6NEV1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRR23AA6NEV1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRR23AA6NEV1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRR23AA6NEV1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRR23AA6NEV1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms