Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DTX4Q9Y2E6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms