Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms